اهم فعالیت‌های بخش در راستای خدمات تخصصی:

• انجام تست‌های تشخیصی عامل عفونت مالاریا (پلاسمودیوم) در میزبان انسانی و ناقلین

• فعالیت و مشارکت در ارزیابی برنامه‌های حذف بیماری مالاریا با روش‌های مولکولی و سرولوژیک

• تشخیص و پایش مولکولی مقاومت به داروهای ضد مالاریایی

• تشخیص موارد بدون علامت مالاریا

• تشخیص و تأیید گونه‌های آلوده‌کننده در موارد مشکوک و وارده از سایر کشورهای آندمیک مالاریا

• شناسایی و ارزیابی آزمایشگاه‌های همکار در نقاط مختلف کشور با استفاده از ظرفیت‌های استقراریافته انستیتو پاستور ایران در زمینه سیستم تضمین کیفیت و ممیزی سیستم

• مشارکت در امر آموزش آزمایشگاه‌های مراکز بهداشتی-درمانی و برگزاری دوره‌های آموزشی در قالب کارگاه‌های آموزشی، دوره‌های بازآموزی کوتاه‌مدت و میان‌مدت ملی، منطقه‌ای و میدانی

• مشاوره با سایر مراکز همکار در زمینه حل مشکلات و بهینه‌سازی روش‌های تشخیصی و تحقیقی مرتبط

• تهیه بسته‌های آموزشی در خصوص معرفی و بهینه‌سازی روش‌های تشخیصی موجود و نوین مالاریا با همکاری آزمایشگاه مرجع سلامت کشور و  WHO

• تهیه بسته‌های آموزشی در خصوص پیشگیری، تشخیص و درمان مالاریا با همکاری مرکز مدیریت مبارزه با بیماری‌های واگیر وزارت بهداشت

• مشارکت فعال در اجرای برنامه ارزیابی خارجی کیفیت  (EQAS)

• مشارکت در ارزیابی کیت‌های تشخیصی تولیدشده و یا واردشده با همکاری معاونت غذا و دارو وزارت بهداشت و تحت نظر آزمایشگاه مرجع سلامت کشور

•  مشارکت در تدوین و به‌روزرسانی دستورالعمل‌ها و استاندارد کشوری روش‌های تشخیص مالاریا با همکاری آزمایشگاه مرجع سلامت کشور و موسسه استاندارد

• مشارکت در برنامه‌های کشوری، منطقه‌ای و بین‌المللی غربالگری مالاریا با همکاری مرکز مدیریت مبارزه با بیماری‌های واگیر وزارت بهداشت

• مشارکت فعال در حل بحران‌های احتمالی کشوری مرتبط با بیماری مالاریا تحت نظارت مرکز مدیریت مبارزه با بیماری‌های واگیر وزارت بهداشت

• همکاری در اجرای برنامه‌های ممیزی داخلی و یا کشوری به درخواست آزمایشگاه مرجع سلامت کشور

• همکاری در برگزاری سمینارهای کشوری و بین‌المللی مرتبط

• گسترش همکاری با سایر مراکز علمی داخل و خارج از کشور در قالب عقد تفاهم‌نامه‌های فی‌مابین

• همکاری و پشتیبانی در راه‌اندازی آزمایشگاه‌های مرجع منطقه‌ای و دانشگاهی  و تقویت توانمندی شبکه تشخیص آزمایشگاهی در زمینه تشخیص عفونت مالاریا

• همکاری در تدوین چک‌لیست تخصصی اعتباربخشی آزمایشگاه‌های مرجع منطقه‌ای 

• همکاری در انجام طرح‌های تحقیقاتی کاربردی و استراتژیک در زمینه کنترل عفونت مالاریای کشور پس از تصویب در کمیته فنی کشوری مبارزه با مالاریا 

اهم فعالیت‌های بخش در راستای تولید فرآورده:

1. پروژه ملی لارودرمانی با بودجه وزارت بهداشت
2. پروژه کلان کیت مولکولی تشخیص مقاومت به سموم آفت‌کش با بودجه صندوق فناوری تهران
3. پروژه توسعه و تولید واکسن‌های ممانعت کننده از انتقال با حمایت مرکز مدیریت بیماری‌ها، انستیتو پاستور ایران و سازمان جهانی بهداشت
4. پروژه پرورش و به‌کارگیری زالو در درمان بیماری‌ها